（1）凝膠成像：可以對(duì)蛋白質(zhì)凝膠，DNA凝膠，RNA凝膠樣品進(jìn)行圖象采集，并可應(yīng)用成像系統(tǒng)自帶軟件直接進(jìn)行分析。樣品包括：EtBr、SYBR Green、SYBR Gold、Texas Red、GelStar、Fluoroscecin、 Radiant Red等染色的核酸凝膠；以及Coomassie Blue、SYPRO Orange、銀染的蛋白質(zhì)凝膠等。

 

（2）其他樣品成像：96孔板、培養(yǎng)皿等白光或自然光可激發(fā)的樣品成像。用成像系統(tǒng)成像由于焦距、光圈等參數(shù)可固定，圖像質(zhì)量更加均一，要優(yōu)于手持相機(jī)拍攝。

 

（3）半定量分析：根據(jù)分子量標(biāo)準(zhǔn)的分子量和濃度，可以對(duì)核酸或蛋白質(zhì)的分子量、濃度、相對(duì)含量等進(jìn)行半定量分析。該分析主要是根據(jù)條帶的位置和條帶亮度與分子量標(biāo)準(zhǔn)的位置及亮度比對(duì)得到的結(jié)果，該結(jié)果要遠(yuǎn)準(zhǔn)確于肉眼的觀察和估計(jì)。另外，有些系統(tǒng)可進(jìn)行遺傳樹分析和VNTRs等分析（如北京賽智ChampGel, SmartGel凝膠成像系統(tǒng)），可以便于在遺傳學(xué)水平上進(jìn)行分析。

 

（4）菌落計(jì)數(shù)分析：可以對(duì)培養(yǎng)皿上的菌落進(jìn)行計(jì)數(shù)，可以降低手動(dòng)計(jì)數(shù)帶來的誤差。

 

（5）點(diǎn)雜交分析：微孔板或膜上的雜交反應(yīng)進(jìn)行定性和半定量分析，可以根據(jù)閾值分辨出陰性和陽性雜交，并計(jì)算出濃度值。

 

（6）測(cè)量分析：對(duì)樣品的長(zhǎng)度進(jìn)行測(cè)量，適用于生物樣本的長(zhǎng)度測(cè)量，抗生素效價(jià)的計(jì)算等。